Veel verbindingen worden gezuiverd door kristallisatie uit een waterige oplossing. Het kristal sluit veel verontreinigingen uit, maar water kan in het kristallijne rooster passen zonder chemisch gebonden te zijn aan het kation van de verbinding. Door warmte toe te voeren kan dit water worden verdreven, maar het proces beschadigt meestal de kristallijne structuur. Dit is prima als het doel is om een zuivere verbinding te verkrijgen. Het kan ongewenst zijn bij het kweken van kristallen voor kristallografie of andere doeleinden.
Soms worden de twee vormen gecombineerd. [Cu (H2O)4]ZO4· H2O kan worden gebruikt om het kristalwater van koper (II) sulfaat te beschrijven.
Water is een klein, polair molecuul dat gemakkelijk wordt opgenomen in kristalroosters, maar het is niet het enige oplosmiddel dat in kristallen wordt aangetroffen. In feite blijven de meeste oplosmiddelen in meer of mindere mate in het kristal achter. Een bekend voorbeeld is benzeen. Om het effect van een oplosmiddel te minimaliseren, proberen chemici doorgaans zoveel mogelijk te verwijderen met vacuümextractie en kunnen ze een monster verwarmen om het resterende oplosmiddel af te drijven. Röntgenkristallografie kan vaak oplosmiddelen in een kristal detecteren.