RNA-definitie en voorbeelden

RNA is het acroniem voor ribonucleïnezuur. Ribonucleïnezuur is een biopolymeer gebruikt om te coderen, decoderen, reguleren en uit te drukken genen. Vormen van RNA omvatten boodschapper-RNA (mRNA), transfer-RNA (tRNA) en ribosomaal RNA (rRNA). RNA codeert voor aminozuur sequenties, die kunnen worden gecombineerd om te vormen eiwitten. Waar DNA wordt gebruikt, fungeert RNA als intermediair en transcribeert de DNA-code zodat deze in eiwitten kan worden vertaald.

RNA bestaat uit nucleotiden gemaakt van een ribosesuiker. De koolstofatomen in de suiker zijn genummerd van 1 'tot 5'. Een purine (adenine of guanine) of pyrimidine (uracil of cytosine) wordt aan de 1 'koolstof van de suiker gehecht. Hoewel RNA wordt getranscribeerd met alleen deze vier basen, worden ze vaak gewijzigd om meer dan 100 andere basen op te leveren. Deze omvatten pseudouridine (Ψ), ribothymidine (T, niet te verwarren met de T voor thymine in DNA), hypoxanthine en inosine (I). Een fosfaatgroep gehecht aan de 3 'koolstof van één ribosemolecuul hecht zich aan de 5' koolstof van het volgende ribosemolecuul. Omdat de fosfaatgroepen op een ribonucleïnezuurmolecuul negatieve ladingen dragen, wordt RNA ook elektrisch geladen. Er vormen zich waterstofbruggen tussen adenine en uracil, guanine en cytosine, en ook guanine en uracil. Deze waterstofbruggen vormen structurele domeinen, zoals haarspeldlussen, interne lussen en uitstulpingen.

Beide RNA en DNA zijn nucleïnezuren, maar RNA gebruikt het monosaccharide ribose, terwijl DNA is gebaseerd op de suiker 2'-deoxyribose. Omdat RNA een extra hydroxylgroep op zijn suiker heeft, is het labieler dan DNA, met een lagere activeringsenergie voor hydrolyse. RNA gebruikt de stikstofbasen adenine, uracil, guanine en thymine, terwijl DNA adenine, thymine, guanine en thymine gebruikt. Ook is RNA vaak een enkelstrengs molecuul, terwijl DNA een dubbelstrengs helix is. Een ribonucleïnezuurmolecuul bevat echter vaak korte stukjes helices die het molecuul op zichzelf vouwen. Deze gepakte structuur geeft RNA de capaciteit om als katalysator te dienen, net zoals eiwitten als enzymen kunnen werken. RNA bestaat vaak uit kortere nucleotidestrengen dan DNA.

Er zijn 3 hoofdlijnen soorten RNA:

• Messenger RNA of mRNA: mRNA brengt informatie van DNA naar ribosomen, waar het wordt vertaald om eiwitten voor de cel te produceren. Het wordt beschouwd als een coderend type RNA. Elke drie nucleotiden vormen een codon voor één aminozuur. Wanneer de aminozuren aan elkaar worden gekoppeld en na vertaling worden gewijzigd, is het resultaat een eiwit.
• Breng RNA of tRNA over: tRNA is een korte keten van ongeveer 80 nucleotiden die een nieuw gevormd aminozuur overdragen naar het einde van een groeiende polypeptideketen. Een tRNA-molecuul heeft een anticodon-sectie die aminozuurcodons op mRNA herkent. Er zijn ook aminozuurbindingsplaatsen op het molecuul.
• Ribosomaal RNA of rRNA: rRNA is een ander type RNA dat wordt geassocieerd met ribosomen. Er zijn vier soorten rRNA bij mensen en andere eukaryoten: 5S, 5.8S, 18S en 28S. rRNA wordt gesynthetiseerd in de nucleolus en het cytoplasma van een cel. rRNA combineert met proteïne om een ​​ribosoom in het cytoplasma te vormen. Ribosomen binden vervolgens mRNA en voeren eiwitsynthese uit.

Naast mRNA, tRNA en rRNA zijn er veel andere soorten ribonucleïnezuur die in organismen worden aangetroffen. Een manier om ze te categoriseren is door hun rol in eiwitsynthese, DNA-replicatie en post-transcriptionele modificatie, genregulatie of parasitisme. Enkele van deze andere soorten RNA zijn onder meer:

• Transfer-messenger-RNA of tmRNA: tmRNA wordt gevonden in bacteriën en herstart vastgelopen ribosomen.
• Klein nucleair RNA of snRNA: snRNA wordt gevonden in eukaryoten en archaea en werkt in splicing.
• Telomerase RNA-component of TERC: TERC wordt gevonden in eukaryoten en functies in telomere synthese.
• Enhancer RNA of eRNA: eRNA maakt deel uit van genregulatie.
• Retrotransposon: Retrotransposons zijn een soort van zichzelf voortplantend parasitair RNA.

• Barciszewski, J.; Frederic, B.; Clark, C. (1999). RNA biochemie en biotechnologie. Springer. ISBN 978-0-7923-5862-6.
• Berg, J.M.; Tymoczko, J.L.; Stryer, L. (2002). Biochemie (5e ed.). WH Freeman and Company. ISBN 978-0-7167-4684-3.
• Cooper, G.C.; Hausman, R.E. (2004). De cel: een moleculaire benadering (3e ed.). Sinauer. ISBN 978-0-87893-214-6.
• Söll, D.; RajBhandary, U. (1995). tRNA: structuur, biosynthese en functie. ASM Press. ISBN 978-1-55581-073-3.
• Tinoco, I.; Bustamante, C. (Oktober 1999). "Hoe RNA vouwt". Journal of Molecular Biology. 293 (2): 271–81. doi: 10.1006 / jmbi.1999.3001