Er zijn enkele verschillen en enkele overeenkomsten tussen klein interfererend RNA (siRNA) en micro-RNA (miRNA). Het dubbelstrengs siRNA kan ook bekend staan als kort interfererend RNA of silencing RNA. Micro-RNA is een niet-gecodeerd molecuul. Ribonucleïnezuur (RNA) is nodig voor biologische codering en de expressie van genen in alle levende wezens.
Wat zijn siRNA en miRNA?
Voordat je de manieren kunt begrijpen waarop siRNA en miRNA vergelijkbaar zijn en hoe ze verschillen, helpt het om te weten wat ze zijn. Zowel siRNA als miRNA zijn proteomics-instrumenten die worden gebruikt om verschillende aspecten van genexpressie te bestuderen. Proteomics is de studie van eiwitten waarmee het volledige complement van eiwitten van een cel tegelijk wordt onderzocht. Technologische vooruitgang heeft een dergelijke studie mogelijk gemaakt.
Dus zijn siRNA en miRNA vergelijkbaar of verschillend? De jury is nog steeds enigszins uit op die vraag, afhankelijk van wie je het vraagt. Sommige bronnen zijn van mening dat siRNA en miRNA hetzelfde zijn, terwijl anderen aangeven dat het volledig afzonderlijke entiteiten zijn.
Het meningsverschil ontstaat omdat de twee beide op dezelfde manier zijn gevormd. Ze komen voort uit langere RNA-voorlopers. Ze worden ook allebei verwerkt in het cytoplasma enzym Dicer genoemd voordat hij onderdeel werd van het eiwitcomplex RISC. Enzymen zijn eiwitten die de reactiesnelheid tussen biomoleculen kunnen verbeteren.
Er zijn kleine verschillen tussen de twee
Het proces van RNA-interferentie (RNAi) kan door beide worden gemodereerd siRNA of miRNA, en er zijn subtiele verschillen tussen de twee. Zoals vermeld, worden beide in de cel verwerkt door het enzym Dicer en opgenomen in het complexe RISC.
siRNA wordt beschouwd als exogeen dubbelstrengs RNA dat door cellen wordt opgenomen. Met andere woorden, het komt binnen vectoren, zoals virussen. Vectoren ontstaan wanneer genetici stukjes DNA gebruiken om een gen te klonen om een genetisch gemodificeerd organisme (GMO) te produceren. Het DNA dat bij dit proces wordt gebruikt, wordt een vector genoemd.
Hoewel men denkt dat siRNA exogeen dubbelstrengs RNA is, is miRNA enkelstrengs. Het komt van endogeen niet-coderend RNA, wat betekent dat het in de cel is gemaakt. Dit RNA wordt aangetroffen in de introns van grotere RNA-moleculen.
Een paar andere verschillen
Een ander verschil tussen siRNA en miRNA is dat siRNA typisch perfect bindt aan zijn mRNA-doelwit bij dieren. Het past perfect bij de reeks. Daarentegen kan miRNA de vertaling van veel verschillende mRNA-sequenties remmen omdat de koppeling niet perfect is. Vertaling vindt plaats nadat messenger-RNA is gewijzigd en zich bindt aan een bepaalde site op een ribosoom. In planten heeft miRNA de neiging om een meer perfect complementaire sequentie te hebben, wat mRNA-splitsing induceert in tegenstelling tot alleen repressie van translatie.
siRNA en miRNA kunnen beide een rol spelen bij epigenetica door een proces dat RNA-geïnduceerde transcriptionele uitschakeling (RITS) wordt genoemd. Epigenetica is de studie van erfelijke genetische informatie waarbij de nucleotidesequentie van DNA niet wordt gewijzigd maar zich manifesteert als chemische markeringen. Deze markeringen worden na replicatie aan DNA- of chromatine-eiwitten toegevoegd. Evenzo zijn beide belangrijke doelen voor therapeutisch gebruik vanwege de rol die ze spelen in de controlerende genexpressie.