De Confederate States of America (CSA) werd opgericht in februari 1861. De daadwerkelijke burgeroorlog begon op 12 april 1861. Slechts vijf dagen later werd Virginia de achtste staat die zich van de Unie afscheidde. De beslissing om zich af te scheiden was allesbehalve unaniem en resulteerde in de vorming van West Virginia op 26 november 1861. Deze nieuwe grensstaat scheidde zich niet van de Unie. West Virginia is de enige staat die werd gevormd door zich af te scheiden van een Geconfedereerde staat. Artikel IV, afdeling 3 van de grondwet van de Verenigde Staten bepaalt dat er binnen een staat geen nieuwe staat kan worden gevormd zonder toestemming van die staat. Met de afscheiding van Virginia werd dit echter niet afgedwongen.
Virginia had de grootste bevolking in het zuiden en de legendarische geschiedenis speelde een enorme rol bij de oprichting van de VS Het was de geboorteplaats en het huis van presidenten George Washington en Thomas Jefferson. In mei 1861 werd Richmond, Virginia de hoofdstad van de CSA omdat het de natuurlijke hulpbronnen had die de Zuidelijke regering zo hard nodig had om effectief een oorlog tegen de Unie te voeren. Hoewel de stad Richmond slechts 100 mijl van de Amerikaanse hoofdstad Washington, D.C. ligt, was het een grote industriële stad. Richmond was ook de thuisbasis van Tredegar Iron Works, een van de grootste gieterijen in de VS vóór het begin van de burgeroorlog. Tijdens de oorlog produceerde Tredegar meer dan 1000 kanonnen voor de Confederatie en bepantsering voor oorlogsschepen. Daarnaast produceerde de industrie van Richmond een aantal verschillende oorlogsmaterialen zoals munitie, geweren en zwaarden en leverde het ook uniformen, tenten en lederwaren aan het Geconfedereerde Leger.
Gevechten in Virginia
De meeste gevechten in het Eastern Theatre van de Amerikaanse Burgeroorlog vonden plaats in Virginia, voornamelijk vanwege de noodzaak om Richmond te beschermen tegen verovering door troepen van de Unie. Deze veldslagen omvatten de Battle of Bull Run, ook wel bekend als de First Manassas. Dit was de eerste grote veldslag van de burgeroorlog op 21 juli 1861 en ook een grote Zuidelijke overwinning. Op 28 augustus 1862 begon de Tweede Battle of Bull Run. Het duurde drie dagen met meer dan 100.000 soldaten op het slagveld. Deze strijd eindigde ook met een Zuidelijke overwinning.
Hampton Roads, Virginia was ook de locatie van de eerste zeeslag tussen ijzersterke oorlogsschepen. De USS Monitor en de CSS Virginia vochten in maart 1862. Andere grote landgevechten in Virginia zijn Shenandoah Valley, Fredericksburg en Chancellorsville.
Op 3 april 1865 evacueerden de Zuidelijke strijdkrachten en de regering hun hoofdstad in Richmond en troepen werden bevolen alle industriële pakhuizen en bedrijven te verbranden die voor Union van enige waarde zouden zijn krachten. Tredegar Irons Works was een van de weinige bedrijven die de verbranding van Richmond overleefde, omdat de eigenaar het had beschermd door middel van gewapende bewakers. Het oprukkende leger van de Unie begon de branden snel te blussen, waardoor de meeste woonwijken voor vernietiging werden behoed. Het zakendistrict deed het niet zo goed en sommigen schatten dat ten minste vijfentwintig procent van de bedrijven een totaal verlies leed. In tegenstelling tot de vernietiging van het zuiden door generaal Sherman tijdens zijn 'Mars naar de zee', waren het de Zuidelijken zelf die de stad Richmond vernietigden.
Op 9 april 1865 bleek de Battle of Appomattox Court House de laatste belangrijke slag van de Civil Was te zijn, evenals de laatste slag om generaal Robert E. Lee. Hij zou zich daar officieel overgeven aan Union Generaal Ulysses S. Verlenen op 12 april 1865. De oorlog in Virginia was eindelijk voorbij.