De Alchemist is een roman geschreven in twee delen en een epiloog. Het draait om een Andalusische herder genaamd Santiago en zijn zoektocht naar zijn eigen persoonlijke legende, die hem van zijn dorp naar de piramides van Egypte brengt. Tijdens zijn reizen ontmoet hij een reeks personages die hem direct helpen of hem een waardevolle les leren door bijvoorbeeld een voorbeeld te geven.
Melchizedek en de alchemist worden mentoren, terwijl de Engelsman een voorbeeld geeft van wat er gebeurt als je hoopt te verwerven kennis voornamelijk uit boeken, en de kristalhandelaar toont hem het soort leven dat men leidt als men geen aandacht schenkt aan een Persoon Legende. De Alchemist speelt zich af in een universum waar elk wezen zijn eigen persoonlijke legende heeft, en waar de wereld een ziel heeft die door alles wordt gedeeld, van levende wezens tot ruwe materie.
Deel een
Santiago is een jonge herder uit Andalusië en is blij met een aanstaande reis naar een stad waar hij vorig jaar was geweest, omdat hij een meisje had ontmoet waar hij verliefd op was geworden. Ze is de dochter van een koopman die wol van hem koopt, een man met vertrouwensproblemen die eist dat Santiago zijn schapen voor hem scheert om fraude te voorkomen. Hij slaapt in een verlaten kerk, waar hij een terugkerende droom heeft over het zien van piramides. Als hij het aan een zigeunervrouw uitlegt, interpreteert ze het vrij eenvoudig en zegt dat hij inderdaad naar Egypte moet reizen om een begraven schat te vinden. In het begin aarzelt hij omdat hij geniet van zijn leven als herder en hij moest tegen de wil van zijn ouders in om het na te streven, omdat ze wilden dat hij priester werd.
Hij komt dan een oude man tegen die Melchizedek heet, die het concept van 'Personal Legend' uitlegt, de persoonlijke vervulling die iedereen moet nastreven. Het is "wat je altijd al wilde bereiken. Als ze jong zijn, weet iedereen wat hun persoonlijke legende is. 'Hij vertelt hem dat hij naar voortekenen moet luisteren om zijn schat, en hij geeft hem twee magische stenen, Urim en Tummim, die "ja" en "nee" antwoorden op de vragen waarop hij geen antwoord kan vinden door hemzelf.
Santiago bereikt Tanger nadat hij zijn schapen heeft verkocht, maar eenmaal daar wordt hij beroofd van al zijn geld door een man die hem had verteld dat hij hem naar de piramiden kon brengen. Dit maakt hem niet al te veel in de war, omdat hij begint te werken voor een kristalhandelaar, waardoor hij het bedrijf van zijn werkgever versterkt met zijn slimme ideeën. De kristalhandelaar had vroeger zelf een persoonlijke legende - hij maakte een pelgrimstocht naar Mekka - maar hij gaf het op.
Deel twee
Zodra Santiago genoeg geld verdient, weet hij niet wat hij moet doen. Elf maanden zijn verstreken en hij weet niet zeker of hij naar Andalusië moet terugkeren om schapen te kopen met zijn verdiensten of door te gaan met zijn zoektocht. Hij voegt zich uiteindelijk bij een caravan om naar de piramides te reizen. Daar ontmoet hij een medereiziger, bekend als de Engelsman, die zich bezighoudt met alchemie. Hij gaat naar de Al-Fayoum-oase om een alchemist te ontmoeten, terwijl hij hoopt te leren hoe hij van elk metaal goud kan maken. Tijdens een reis door de woestijn leert Santiago hoe hij in contact kan komen met de ziel van de wereld.
Oorlogen sudderen in de woestijn, dus de karavaan blijft voorlopig in de oase. Santiago besluit de Engelsman te helpen de alchemist te vinden. Hun bron van informatie is Fatima, een meisje dat hij ontmoet terwijl ze water uit de put haalt en op wie hij prompt verliefd wordt. Hij stelt haar een huwelijk voor, en zij geeft toestemming, op voorwaarde dat hij zijn zoektocht voltooit. Ze is een 'woestijnvrouw' die de voortekenen kan lezen en weet dat iedereen moet vertrekken voordat ze terugkeert.
Nadat hij zich in de woestijn heeft gewaagd, heeft Santiago een visioen, met dank aan twee haviken die elkaar aanvallen, van de aangevallen oase. Een oase aanvallen is een overtreding van de regels van de woestijn, dus hij vertelt het aan de stamhoofden, maar ze zeggen dat hij met zijn leven zal moeten boeten als de oase niet wordt aangevallen. Kort na dit visioen ontmoet hij een vreemdeling in zwarte gewaden bovenop een wit paard die zich openbaart als de alchemist.
De oase wordt wel aangevallen en dankzij de waarschuwing van Santiago kunnen de bewoners de overvallers verslaan. Dit blijft niet onopgemerkt door de alchemist die op zijn beurt besluit om Santiago te begeleiden en hem te helpen de piramides te bereiken. Ze worden echter al snel gevangengenomen door een andere groep krijgers in de woestijn. De alchemist vertelt Santiago dat hij, om de reis voort te zetten, de wind moet worden.
Meer en meer bekend met de ziel van de wereld, concentreert Santiago zich op de woestijn en slaagt er uiteindelijk in de wind te worden. Dit maakt de ontvoerders bang, die hem en de alchemist prompt vrijlaten.
Ze halen het tot een klooster, waar de alchemist wat lood in goud verandert en verdeelt. Zijn reis stopt hier, omdat hij terug moet naar de oase, maar Santiago gaat verder en bereikt uiteindelijk de piramides. Hij begint te graven op de plek waar hij van droomde zijn schat te vinden, maar wordt overvallen door overvallers en krijgt een zware klap. Een van de overvallers, na navraag te hebben gedaan naar wat Santiago daar deed, bespot hem vanwege zijn droom en noemde dat hij had een droom over een schat begraven door een verlaten kerk in Spanje, en dat hij niet dom genoeg was om na te jagen het.
Nawoord
Dit geeft Santiago het antwoord waarnaar hij op zoek was. Zodra hij terugkeert naar de kerk in Spanje, graaft hij prompt de schat op, herinnert zich dat hij een deel ervan aan de zigeunervrouw te danken heeft en besluit zich te herenigen met Fatima.